Omics Data Science
Omics Data Science – Bioinformatyka i Analiza Wielkoskalowych Danych Biomedycznych
Dwusemestralny kurs podyplomowy prowadzony w ICM UW, który wychodzi naprzeciw rosnącym potrzebom rynku oraz świata nauki, w zakresie zatrudnienia ekspertów zajmujących się danymi omicznymi.
Kurs dedykowany jest osobom pracującym lub planującym dalszy rozwój kariery m.in. w:
- placówkach naukowo-badawczych,
- przemyśle biotechnologicznym i bioinformatycznym,
- diagnostyce medycznej,
- placówkach klinicznych,
- firmach farmaceutycznych,
- ośrodkach oceny genetycznej zwierząt i roślin.
Program
Program kursu obejmuje swoim zakresem wprowadzenie do analizy danych biomedycznych, opis podstawowych narzędzi bioinformatycznych a także prezentację wyzwań współczesnej genetyki. Zajęcia umożliwią również praktyczne wykorzystanie umiejętności nabytych w trakcie ćwiczeń dedykowanych analizie danych omicznych.
Omics Data Science to 12 spotkań i ponad 200 godzin zajęć o charakterze praktycznym, które prowadzą wybitni specjaliści z najlepszych ośrodków naukowo-badawczych w Polsce. Kurs podzielony jest na dwa, stale poszerzane moduły:
I. Wprowadzenie do analizy danych wysokoprzepustowych
- Badania wysokoprzepustowe w medycynie – wprowadzenie
- Infrastruktura w badaniach wysokoprzepustowych
- Podstawowe narzędzia informatyczne
- Podstawy analizy z wykorzystaniem pakietu R
- Podstawa analizy danych genomowych
- Narzędzia wykorzystywane w badaniach biomedycznych w analizach omicznych (Systemy wirtualizacji, Big Data, Deep Learning )
- Podstawowe bazy danych i narzędzia do analizy danych wysokoprzepustowych
II. Praktyczne wykorzystanie analiz wysokoprzepustowych
- Etyczne aspekty biomedycznych badań wysokoprzepustowych
- Genomika
- Transkryptomika*
- Epigenomika*
- Metagenomika / Mikrobiom
- Proteomika
- Metabolomika
* Zastosowanie technik „single-cell”
Program kursu jest realizowany w oparciu o infrastrukturę obliczeniową Centrum Danych ICM UW. Jednocześnie implementujemy najnowsze rozwiązania branży MedTech w zakresie analizy genomicznej, co pozwala kursantom na porównanie wyuczonych metod informatycznych z ich komercyjnymi odpowiednikami.
